Julien Toqueboeuf a débuté sa carrière en 1998 dans des fonctions d’audit chez Bouygues SA, puis chez Bouygues Construction. Il rejoint en 2005 le pôle Energies et Services en tant que directeur financier du pôle Facility Management et Télécoms puis secrétaire général des Infrastructures de réseaux. En 2014, il devient directeur financier de Plan Group, filiale de Bouygues Energies & Services au Canada. En 2017, il devient directeur financier de Bouygues Construction SA, puis secrétaire général du pôle Energies et Services en 2018. En octobre 2019, il est nommé secrétaire général du groupe Bouygues Construction. En octobre 2022, il intègre à son périmètre la direction Audit et Contrôle interne.

Julien Toqueboeuf est membre du Comité Exécutif de Bouygues Construction.